Информация для интересующихся.
Если хочется использовать Qt-шный интерфейс LyX (lyx-qt) и при этом получить отображение математических символов на экране, то этого можно добиться путём запуска lyx-qt со сброшенной локалью.
zigzag> LANG=C lyx-qt
Причина глюков с русской локалью в том, что разработчики LyX и Qt не могут договориться о методах представления нестандартных кодировок. Просвета там не видно.